生物多样性保护学院本科学生在JCR二区期刊发表研究论文

2021年3月,生物多样性保护学院森林保护专业2018级本科生赵薇同学为第一作者,以中国竞彩网为第一单位在二区期刊Frontiers in Microbiology (微生物学领域的Top期刊之一,IF=5.640)发表木腐菌相关研究论文。木腐菌 (Wood-decaying fungi) 是以木材为生长基质的一类大型担子真菌,它们能将木材中的木质素、纤维素和半纤维素全部降解,是森林生态系统的重要组成部分,也是分解纤维素和木材原始成分木质素的主要动力,在物质循环和能量流动中起着关键的降解还原作用。

该研究论文采用形态学与分子生物学相结合的方法,运用试剂盒法进行DNA提取、PCR扩增、电泳检测、送公司测序得到ITS和nLSU片段序列,通过GenBank进行BLAST比对,采用最大简约法、最大似然法及贝叶斯法构建研究序列与其相关序列的系统发育树,揭示了Trechispora Trechispora bambusicola,Trechispora fimbriata和 Trechispora fissurata等3个物种为菌根菌的木生真菌一个分支,是重要工业工程菌。系统发育树研究明确了其聚类于Trechispora内,T. bambusicola 形成独立分支,后与 T. rigida 和T. stevensonii聚为一类,而 Trechispora fimbriata 与T. nivea形成姊妹物种;Trechispora fissurata 与 T. thelephora形成较近分支且聚类最近。

基于ITS+nLSU分子片段构建了科属级别的系统发育树,结果表明:共包涵 1034 characters (ITS), Maximum parsimony analysis yielded 26 equally parsimonious trees (TL=2048, CI=0.4561, HI= 0.5439, RI=0.6174, RC=0.2816). Best model in the Bayesian analysis: GTR+I+G, lset nst=6, rates=invgamma; prset statefreqpr=dirichlet(1,1,1,1). Bayesian analysis with an average standard deviation of split frequencies= 0.009985 (BI),其揭示了在热带和亚热带外生菌根菌研究较多,但是木生外生菌根菌实为罕见,开展植物与Trechispora分子互作关系的研究前景广阔。(文/图:赵长林/审核:付建生/责任编辑:史桓恺)